Los criadores de flores están refinando continuamente sus métodos para producir flores de alta calidad. Las especies se consideran las orquídeas más importantes cultivadas comercialmente. Los avances en la tecnología de ingeniería genética han proporcionado a los investigadores nuevas herramientas que se pueden utilizar junto con los métodos de cría tradicionales para mejorar los rasgos florales y la calidad. Sin embargo, la aplicación de técnicas moleculares para la cría de nuevas especies ha sido relativamente rara. En este estudio, construimos plásmidos recombinantes que contienen genes relacionados con el color de la flor, Chalcone sintasa y/o Flavonoide 3,5-hidroxilasa. Estos genes fueron transformados en plantas de orquídeas utilizando una pistola de genes o un método basado en Agrobacterium. En comparación con el WT, las plantas transgénicas mostraron un color más profundo y un mayor contenido de antocianinas. Además, una comparación fenotípica con controles de tipo salvaje indicó que las plantas transgénicas produjeron más ramas, pétalos y pétalos labiales. Además, ambas plantas transgénicas mostraron un color de labio más intenso en comparación con el control. Sin embargo, la intensidad de la coloración de los labios disminuyó cuando los protocormos fueron co-transformados con ambos genes. Los resultados de este estudio confirman que Chalcone sintasa y Flavonoide 3,5-hidroxilasa afectan el color de la flor en orquídeas y pueden ser relevantes para la cría de nuevas variedades de orquídeas con rasgos de floración deseables.