y Genes en Ajo (L.): Identificación a Nivel del Genoma, Caracterización y Respuesta al Estrés
Autores: Filyushin, Mikhail A.; Anisimova, Olga K.; Shchennikova, Anna V.; Kochieva, Elena Z.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
y Genes en Ajo (L.): Identificación a Nivel del Genoma, Caracterización y Respuesta al Estrés
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Deshidratación
Unión de elementos
Factores de transcripción
Respuestas al estrés
Bioinformática
Transcriptómica comparativa
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Los factores de transcripción (TFs) de la subfamilia A1 y A2, que responden a la deshidratación y están involucrados en las respuestas al estrés en las plantas, aún no se han reportado en especies. En este estudio, utilizamos bioinformática y transcriptómica comparativa para identificar y caracterizar los genes A1 y A2 redundantes en el ajo (L.) y analizar su expresión en cultivares que difieren en sensibilidad al frío y a la infección. Se identificaron ocho genes A1 () y ocho genes A2 (). Los genes ubicados en tándem en el cromosoma 1 mostraron patrones de expresión similares, lo que sugiere redundancia funcional. Los genes se dispersaron en diferentes cromosomas y presentaron expresiones específicas de órgano y genotipo. Los promotores y contenían 7 y 9 elementos reguladores sensibles a hormonas y estrés, respectivamente, y 13 sitios asociados con la unión de TF y el desarrollo de las plantas. En los cultivares resistentes y sensibles, la infección fúngica aumentó la expresión de los genes , , , , y y disminuyó la de , pero la magnitud de la respuesta dependió de la susceptibilidad a la infección del cultivar. La exposición al frío aumentó fuertemente la expresión de los genes, pero disminuyó la de la mayoría de los genes. Nuestros resultados proporcionan la base para un análisis funcional adicional de los TFs DREB en cultivos y podrían contribuir a la mejora de variedades tolerantes al estrés.
Descripción
Los factores de transcripción (TFs) de la subfamilia A1 y A2, que responden a la deshidratación y están involucrados en las respuestas al estrés en las plantas, aún no se han reportado en especies. En este estudio, utilizamos bioinformática y transcriptómica comparativa para identificar y caracterizar los genes A1 y A2 redundantes en el ajo (L.) y analizar su expresión en cultivares que difieren en sensibilidad al frío y a la infección. Se identificaron ocho genes A1 () y ocho genes A2 (). Los genes ubicados en tándem en el cromosoma 1 mostraron patrones de expresión similares, lo que sugiere redundancia funcional. Los genes se dispersaron en diferentes cromosomas y presentaron expresiones específicas de órgano y genotipo. Los promotores y contenían 7 y 9 elementos reguladores sensibles a hormonas y estrés, respectivamente, y 13 sitios asociados con la unión de TF y el desarrollo de las plantas. En los cultivares resistentes y sensibles, la infección fúngica aumentó la expresión de los genes , , , , y y disminuyó la de , pero la magnitud de la respuesta dependió de la susceptibilidad a la infección del cultivar. La exposición al frío aumentó fuertemente la expresión de los genes, pero disminuyó la de la mayoría de los genes. Nuestros resultados proporcionan la base para un análisis funcional adicional de los TFs DREB en cultivos y podrían contribuir a la mejora de variedades tolerantes al estrés.