El avance de las tecnologías de espectrometría de masas ha revolucionado la investigación en metabolómica vegetal al permitir la adquisición de datos brutos de metabolómica. Sin embargo, la identificación, análisis y visualización de estos datos requieren herramientas especializadas. Las soluciones existentes carecen de una base de datos de metabolitos específica para plantas y presentan desafíos de usabilidad. Para abordar estas limitaciones, desarrollamos PlantMetSuite, una herramienta basada en la web para un análisis y visualización integral de metabolómica. PlantMetSuite abarca herramientas de bioinformática interactivas y bases de datos específicamente diseñadas para datos de metabolómica vegetal, facilitando el análisis de arriba hacia abajo en metabolómica y apoyando investigaciones integrativas de multi-ómiques. PlantMetSuite se puede acceder directamente a través del navegador de un usuario sin necesidad de instalación o habilidades de programación. La herramienta está disponible de forma gratuita y se someterá a actualizaciones y expansiones regulares para incorporar bibliotecas adicionales y nuevos métodos de análisis de metabolómica publicados. La importancia de la herramienta radica en empoderar a los investigadores con una plataforma accesible y personalizable para desbloquear conocimientos en metabolómica vegetal.