El cambio climático está ejerciendo impactos significativos en los ecosistemas de todo el mundo, siendo las regiones alpinas particularmente vulnerables. La fauna alpina se comprende relativamente poco, especialmente en terrenos que son difíciles de explorar para los humanos. El conocimiento sobre las especies alpinas se ve limitado aún más por la escasez de técnicas de muestreo que sean ampliamente aplicables en este entorno. Los drones tienen potencial como una herramienta de bajo impacto para el muestreo de fauna en terrenos alpinos remotos. Los diversos lagartos alpinos de Nueva Zelanda son un sistema ideal para explorar nuevas técnicas de muestreo. Nos basamos en investigaciones anteriores que demuestran el potencial de los drones para muestrear lagartos alpinos al evaluar (1) qué tan cerca puede acercarse un dron a diferentes especies de lagartos alpinos en hábitats de scree, talud y pradera de tussock y (2) la efectividad de los muestreos con drones en comparación con las búsquedas visuales sistemáticas tradicionales para estas especies y hábitats. El dron (modelo: DJI Mavic Air 2) pudo acercarse a 0.1-2.5 m de un lagarto (media = 0.77 m) antes de activar una respuesta de vuelo. Las búsquedas visuales sistemáticas superaron a los muestreos con drones en todos los hábitats accesibles para los observadores humanos. Sin embargo, los drones fueron relativamente efectivos en hábitats de talud, demostrando su potencial utilidad en hábitats alpinos rocosos inaccesibles. Las mejoras en la tecnología de drones pueden aumentar aún más la utilidad de los muestreos basados en drones en la investigación ecológica.