La vitamina D ha demostrado ser un fuerte estimulador de mecanismos asociados con la eliminación de patógenos. Debido a su efectividad reconocida contra infecciones virales, durante la infección por SARS-CoV-2, los efectos de la suplementación con vitamina D han sido objeto de debate. Este estudio tiene como objetivo contribuir a este debate mediante un modelo matemático fenomenológico cualitativo en el que se considera explícitamente el papel de la vitamina D y sus interacciones con el sistema inmunológico innato. Mostramos que el flujo y la degradación de la vitamina D pueden considerarse como posibles parámetros de control para la evaluación y recuperación de la enfermedad. Al variar el flujo de vitamina D, se han encontrado tres escenarios dinámicos con diferentes modalidades de recuperación de la enfermedad. Dentro de cada escenario, la degradación de la vitamina D se ha relacionado con diferentes grados de gravedad en el desarrollo de la enfermedad. Curiosamente, la aparición de fenomenologías histéricas cuando el flujo de vitamina D es demasiado bajo puede estar relacionada con el inicio del síndrome de Long-COVID, confirmando evidencia clínica de estudios recientes sobre el tema.