Visualizando la proteína nucleocápside del SARS-CoV-2 en términos de flexibilidad molecular
Autores: Matsuo, Tatsuhito
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Visualizando la proteína nucleocápside del SARS-CoV-2 en términos de flexibilidad molecular
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Coronavirus
Proteínas
Objetivo de fármacos
Estructura molecular
Dinámica
Replicación viral
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 18
Citaciones: Sin citaciones
El último coronavirus SARS-CoV-2, que causa la neumonía por coronavirus 2019 (COVID-19) que lleva a la pandemia, contiene 29 proteínas. Entre ellas, la proteína de nucleocápside (N) es una de las proteínas abundantes y muestra múltiples funciones, incluyendo el empaquetamiento del genoma de ARN durante el ciclo de infección. También ha surgido como un posible objetivo para medicamentos. En esta revisión, se describe el estado actual de la investigación de N en términos de estructura molecular y dinámica. N consta de dos dominios, es decir, el dominio N-terminal (NTD) y el dominio C-terminal (CTD) con una región desordenada entre ellos. Estudios de simulación recientes han identificado varios medicamentos potenciales que pueden unirse a NTD o CTD con alta afinidad. Además, se demostró que el grado de flexibilidad en la región desordenada tiene un gran efecto en la tasa de unión de los medicamentos, lo que sugiere la importancia de la flexibilidad molecular para la función de N. También se ha demostrado que la flexibilidad molecular es integral para la formación de gotas, donde N, ARN y/o otras proteínas virales se agrupan a través de la separación de fases líquido-líquido y se considera importante para la replicación viral. Finalmente, como una de las direcciones de investigación futura, se presenta una estrategia para obtener la información estructural y dinámica sobre las proteínas contenidas en las gotas.
Descripción
El último coronavirus SARS-CoV-2, que causa la neumonía por coronavirus 2019 (COVID-19) que lleva a la pandemia, contiene 29 proteínas. Entre ellas, la proteína de nucleocápside (N) es una de las proteínas abundantes y muestra múltiples funciones, incluyendo el empaquetamiento del genoma de ARN durante el ciclo de infección. También ha surgido como un posible objetivo para medicamentos. En esta revisión, se describe el estado actual de la investigación de N en términos de estructura molecular y dinámica. N consta de dos dominios, es decir, el dominio N-terminal (NTD) y el dominio C-terminal (CTD) con una región desordenada entre ellos. Estudios de simulación recientes han identificado varios medicamentos potenciales que pueden unirse a NTD o CTD con alta afinidad. Además, se demostró que el grado de flexibilidad en la región desordenada tiene un gran efecto en la tasa de unión de los medicamentos, lo que sugiere la importancia de la flexibilidad molecular para la función de N. También se ha demostrado que la flexibilidad molecular es integral para la formación de gotas, donde N, ARN y/o otras proteínas virales se agrupan a través de la separación de fases líquido-líquido y se considera importante para la replicación viral. Finalmente, como una de las direcciones de investigación futura, se presenta una estrategia para obtener la información estructural y dinámica sobre las proteínas contenidas en las gotas.