Características moleculares del virus de la anemia infecciosa aviar en el centro y este de China de 2020 a 2022
Autores: Xu, Shuqi; Zhang, Zhibin; Xu, Xin; Ji, Jun; Yao, Lunguang; Kan, Yunchao; Xie, Qingmei; Bi, Yingzuo
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Características moleculares del virus de la anemia infecciosa aviar en el centro y este de China de 2020 a 2022
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Evolución
CIAV
China
Cepas
Secuencias genómicas
árbol filogenético
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Para evaluar la evolución reciente del CIAV en China, se examinaron 43 parvadas de pollos de las provincias de Henan, Jiangsu, Hubei y Anhui mediante reacción en cadena de la polimerasa durante 2020-2022. De estas, 27 parvadas dieron positivo para ácidos nucleicos de CIAV, incluyendo 12 que fueron positivas para otros virus de inmunosupresión. Además, se aislaron 27 cepas de CIAV y se secuenciaron sus genomas completos. Las cepas AH2001 y JS2002 compartieron la mayor identidad con un 99.56%, y las cepas HB2102 y HB2101 compartieron la menor identidad con un 95.34%. Basado en las secuencias genómicas de estas cepas y cepas de referencia, se construyó un árbol filogenético que se dividió en ocho ramas principales. La mayoría de las cepas se agruparon con las cepas de Asia Oriental, mientras que la cepa HB2101 pertenecía al grupo de Brasil y Argentina. Se detectó un evento de recombinación en múltiples cepas, en el que AH2002 se recombinó de KJ728827/China/2014 (de la provincia de Taiwán) y HN2203, y AH2202 se recombinó de KX811526/China/2017 (de la provincia de Shandong) y HN2203. Todas las cepas obtenidas tenían un sitio de aminoácido altamente patógeno Gln en la posición 394 de la VP1. En general, nuestros hallazgos demuestran la importancia del monitoreo del CIAV y proporcionan datos que ayudan a comprender la evolución del CIAV.
Descripción
Para evaluar la evolución reciente del CIAV en China, se examinaron 43 parvadas de pollos de las provincias de Henan, Jiangsu, Hubei y Anhui mediante reacción en cadena de la polimerasa durante 2020-2022. De estas, 27 parvadas dieron positivo para ácidos nucleicos de CIAV, incluyendo 12 que fueron positivas para otros virus de inmunosupresión. Además, se aislaron 27 cepas de CIAV y se secuenciaron sus genomas completos. Las cepas AH2001 y JS2002 compartieron la mayor identidad con un 99.56%, y las cepas HB2102 y HB2101 compartieron la menor identidad con un 95.34%. Basado en las secuencias genómicas de estas cepas y cepas de referencia, se construyó un árbol filogenético que se dividió en ocho ramas principales. La mayoría de las cepas se agruparon con las cepas de Asia Oriental, mientras que la cepa HB2101 pertenecía al grupo de Brasil y Argentina. Se detectó un evento de recombinación en múltiples cepas, en el que AH2002 se recombinó de KJ728827/China/2014 (de la provincia de Taiwán) y HN2203, y AH2202 se recombinó de KX811526/China/2017 (de la provincia de Shandong) y HN2203. Todas las cepas obtenidas tenían un sitio de aminoácido altamente patógeno Gln en la posición 394 de la VP1. En general, nuestros hallazgos demuestran la importancia del monitoreo del CIAV y proporcionan datos que ayudan a comprender la evolución del CIAV.