De Genes a Respuesta al Estrés: Datos Genómicos y Transcriptómicos Sugerir la Significancia de las Vías de Oligosacáridos de Inositol y Rafinosa en la Adaptación al Ambiente de la Caatinga
Autores: Ferreira-Neto, José Ribamar Costa; Silva, Manassés Daniel da; Binneck, Eliseu; Vilanova, Elayne Cristina Ramos; Melo, Ana Luíza Trajano Mangueira de; Silva, Jéssica Barboza da; de Melo, Natoniel Franklin; Pandolfi, Valesca; Benko-Iseppon, Ana Maria
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
De Genes a Respuesta al Estrés: Datos Genómicos y Transcriptómicos Sugerir la Significancia de las Vías de Oligosacáridos de Inositol y Rafinosa en la Adaptación al Ambiente de la Caatinga
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Importante
Vías metabólicas
INS
RFO
Enzimas
Aplicaciones biotecnológicas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
es una planta forrajera importante y extremófila nativa de la región semárida de la Caatinga brasileña. Recientemente ha sido objeto de investigaciones basadas en ómicas, y los conjuntos de datos generados ofrecen información sobre candidatos biotecnológicamente significativos que aún no han sido examinados a fondo. Las vías de INS (inositol y sus derivados) y RFO (familia de oligosacáridos de rafinosa) emergen como candidatos clave, dado su papel crítico en la fisiología de las plantas. Los compuestos mencionados también se han relacionado con impactos negativos en la absorción de nutrientes en mamíferos, afectando la ingesta nutricional general y el metabolismo. Por lo tanto, estudiar estas vías metabólicas es importante no solo para las plantas, sino también para los animales que dependen de ellas como parte de su dieta. Las vías de INS y RFO se destacaron por su abundancia de loci y enzimas identificados. Las enzimas mostraron redundancia genómica, siendo codificadas por múltiples loci y diversas familias de genes. El análisis filogenómico reveló una expansión de las familias de genes PIP5K y GolS en relación con el ancestro inmediato. Estas enzimas son cruciales para la síntesis de mensajeros secundarios clave y el precursor de RFO, respectivamente. El control transcripcional de las vías estudiadas se asoció con factores de transcripción tipo DOF, CH y BCP1. La identificación de procesos biológicos relacionados con las rutas metabólicas de INS y RFO destacó su importancia en la respuesta a condiciones estresantes prevalentes en el entorno de la Caatinga. Finalmente, los datos de RNA-Seq y qPCR revelaron la influencia relevante de los genes de las vías de INS y RFO en la respuesta a la privación de agua. Nuestro estudio descifra la genética y la transcriptómica de INS y RFO en , arrojando luz sobre su importancia para una planta nativa de la Caatinga y allanando el camino para futuras aplicaciones biotecnológicas en esta especie y más allá.
Descripción
es una planta forrajera importante y extremófila nativa de la región semárida de la Caatinga brasileña. Recientemente ha sido objeto de investigaciones basadas en ómicas, y los conjuntos de datos generados ofrecen información sobre candidatos biotecnológicamente significativos que aún no han sido examinados a fondo. Las vías de INS (inositol y sus derivados) y RFO (familia de oligosacáridos de rafinosa) emergen como candidatos clave, dado su papel crítico en la fisiología de las plantas. Los compuestos mencionados también se han relacionado con impactos negativos en la absorción de nutrientes en mamíferos, afectando la ingesta nutricional general y el metabolismo. Por lo tanto, estudiar estas vías metabólicas es importante no solo para las plantas, sino también para los animales que dependen de ellas como parte de su dieta. Las vías de INS y RFO se destacaron por su abundancia de loci y enzimas identificados. Las enzimas mostraron redundancia genómica, siendo codificadas por múltiples loci y diversas familias de genes. El análisis filogenómico reveló una expansión de las familias de genes PIP5K y GolS en relación con el ancestro inmediato. Estas enzimas son cruciales para la síntesis de mensajeros secundarios clave y el precursor de RFO, respectivamente. El control transcripcional de las vías estudiadas se asoció con factores de transcripción tipo DOF, CH y BCP1. La identificación de procesos biológicos relacionados con las rutas metabólicas de INS y RFO destacó su importancia en la respuesta a condiciones estresantes prevalentes en el entorno de la Caatinga. Finalmente, los datos de RNA-Seq y qPCR revelaron la influencia relevante de los genes de las vías de INS y RFO en la respuesta a la privación de agua. Nuestro estudio descifra la genética y la transcriptómica de INS y RFO en , arrojando luz sobre su importancia para una planta nativa de la Caatinga y allanando el camino para futuras aplicaciones biotecnológicas en esta especie y más allá.