Los cerdos pueden ser colonizados y convertirse en portadores establecidos. Sin embargo, los mecanismos de la respuesta del huésped a la infección son en gran medida poco claros. Este estudio se construyó con el modelo de infección in vitro utilizando células epiteliales intestinales porcinas (IPEC-J2). Se llevó a cabo un perfil transcriptómico de las células IPEC-J2 para caracterizar el efecto de la infección y el tratamiento con lipopolisacáridos (LPS), en el cual la inflamación inducida por LPS fue un control positivo. Al principio, la infección aumentó la tasa de apoptosis celular e indujo una respuesta inflamatoria en IPEC-J2. Luego, los genes regulados al alza se enriquecieron en vías metabólicas, como las de secreción de bilis y absorción de minerales, mientras que los genes regulados a la baja se enriquecieron en vías relacionadas con la inmunidad, como las vías de señalización de receptores tipo Toll y de p53. Además, encontramos 368 genes regulados al alza y 101 genes regulados a la baja en común. Luego, se llevó a cabo un análisis integrador del perfil transcriptómico bajo infección y tratamiento con LPS, y se detectaron ocho genes regulados al alza y un gen regulado a la baja. Entre ellos, hay un gen crítico de la vía de secreción de bilis, y su expresión de ARNm y proteína aumentó significativamente bajo infección y tratamiento con LPS. Así, el gen AQP8 y la vía de secreción de bilis pueden ser importantes en las células IPEC-J2 bajo infección o tratamiento con LPS.