Los vesículos extracelulares (EVs) son nanopartículas naturales secretadas en condiciones fisiológicas y patológicas. Gracias a su potencial diagnóstico, los EVs están siendo cada vez más estudiados como biomarcadores de una variedad de enfermedades, incluidos los trastornos neurológicos. Hasta la fecha, la mayoría de los estudios sobre biomarcadores de EV utilizan sangre como fuente, a pesar de las diferentes desventajas que pueden causar una aislamiento impuro de los EVs. En el presente artículo, proponemos el uso de saliva como una fuente valiosa de EVs que podrían ser estudiados como biomarcadores en un biofluido de fácil acceso. Utilizando un protocolo comparable para la aislamiento de EVs de ambas biopsias líquidas, los EVs salivales mostraron una mayor pureza en términos de coaislados (evaluados mediante análisis de seguimiento de nanopartículas y prueba de Conan). Además, se utilizó espectroscopia Raman para la identificación de la composición bioquímica general de los EVs provenientes de los dos biofluidos diferentes. A pesar de la cantidad limitada de EVs que se pueden aislar de la saliva, el uso de espectroscopia Raman no se vio obstaculizado y pudo proporcionar una caracterización integral de los EVs de manera rápida y repetible. Por lo tanto, la espectroscopia Raman puede representar un punto de inflexión en la aplicación de los EVs salivales en clínicas, aprovechando el simple método de recolección de la biopsia líquida y el enfoque rápido, sensible y libre de etiquetas basado en biofotónica.