Para entender la relación entre la vernalización y las fitohormonas endógenas en la emisión de tallos, se midieron los niveles de fitohormonas y los cambios en el transcriptoma mediante LC-MS/MS y secuenciación de ARN antes de la vernalización (CK), al final de 16 semanas de vernalización (Vel) y a los 5 días después de la vernalización (Re). Un total de 32 compuestos fitohormonales cambiaron significativamente después de la vernalización; especialmente, el contenido de ácido abscísico (ABA) y ácido jasmónico (JA) disminuyó drásticamente más de dieciséis y tres veces en las muestras de Vel y Re. Además, la GA se acumuló después de la vernalización, mientras que el contenido de GA y GA disminuyó. Se identificaron un total de 7471 genes diferencialmente expresados (DEGs) en respuesta a la vernalización. Estos DEGs estaban enriquecidos con términos de GO que incluyen respuesta al estímulo (GO:0050896), respuesta a hormonas (GO:0009725) y desarrollo del sistema de brotes (GO:0048367). El mapeo de KEGG indicó que 16, 13 y 11 DEGs estaban involucrados en la biosíntesis de ácido giberélico (GA), ABA y JA, lo que sugiere un papel negativo de la vernalización en la biosíntesis de fitohormonas. La vernalización también reprimió la expresión de s y s, lo que implica la inhibición de la señalización de ABA y JA. Además, la vernalización juega un papel positivo en la señalización de GA, debido a la regulación a la baja de s. También encontramos que la emisión de tallos inducida por GA podría ser retardada por ABA exógeno y metil jasmonato (MeJA). En total, nuestros resultados sugieren que la vernalización puede promover la emisión de tallos inducida por GA al disminuir los represores de la señalización de GA y eliminar los efectos antagonistas de ABA y JA.