La respiración de los heterótrofos del suelo, principalmente de bacterias y hongos, es una parte sustancial del balance de carbono en los ecosistemas terrestres, que vincula la descomposición de la materia orgánica con el aumento de la concentración de CO2 atmosférico. La comprensión profunda y la predicción de la variación estacional e interanual de los componentes heterótrofos y autótrofos del flujo de CO2 del suelo están limitadas por la falta de mediciones a largo plazo y durante todo el año. Para entender mejor el impacto de los cambios climáticos actuales en las emisiones de CO2 de los suelos en el bosque mixto y el pastizal cortado, medimos el flujo de CO2 cada semana durante 2 años. Los componentes heterótrofos (derivados de la materia orgánica del suelo + hojarasca) y asociados a las raíces (raíces con microorganismos de la rizosfera) fueron particionados mediante el método de exclusión de raíces. El flujo total de CO2 del suelo promedió 500 g C m-2 año-1 en el bosque y 650 g C m-2 año-1 en el pastizal, con participaciones de la temporada fría sin crecimiento (nov-mar) del 22% y 14%, respectivamente. El componente heterótrofo del flujo de CO2 del suelo promedió el 62% en el bosque y el 28% en el pastizal, y fue generalmente estable a lo largo de las estaciones. La redistribución de las cantidades anuales de precipitación, así como su déficit (sequías), redujo la respiración del suelo en un 33-81% y la respiración heterótrofa en un 24-57% durante los períodos secos. Este efecto fue más pronunciado en el pastizal (con una disminución promedio del 56% en comparación con el 39% en el bosque), lo que está relacionado con un menor contenido de humedad del suelo en la capa superior del pastizal durante los períodos secos.