Variantes Genómicas Asociadas con Parámetros Hematológicos y Subpoblaciones de Linfocitos T en una Población de Intercruce de Cerdo Blanco Grande y Cerdo Min
Autores: Niu, Naiqi; Zhao, Runze; Tian, Ming; Zong, Wencheng; Hou, Xinhua; Liu, Xin; Wang, Ligang; Wang, Lixian; Zhang, Longchao
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Variantes Genómicas Asociadas con Parámetros Hematológicos y Subpoblaciones de Linfocitos T en una Población de Intercruce de Cerdo Blanco Grande y Cerdo Min
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Estudio de asociación a nivel del genoma
Loci SNP
Subpoblaciones de linfocitos T
Gen candidato
Recuento de glóbulos blancos
Rasgos inmunitarios
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Se realizó un estudio de asociación a nivel genómico (GWAS) en 489 cerdos F2 de un cruce entre verracos Large White y cerdas Min, centrándose en parámetros hematológicos y subpoblaciones de linfocitos T (17 rasgos). Utilizando el Illumina PorcineSNP60 Genotyping BeadChip, se identificaron loci SNP significativos, particularmente en el cromosoma 7 (SSC7) para el recuento de plaquetas (PLT) y el hematocrito de plaquetas (PCT), con el receptor metabotrópico de glutamato 4 () como gen candidato para PLT. El recuento de glóbulos blancos (WBC) mostró una asociación significativa con SSC12. Para los rasgos de linfocitos T, se encontraron señales significativas en SSC7, SSC2 y SSC5, con genes candidatos que incluyen, canal intracelular de cloruro 5 (), motivo tripartito que contiene 15 () y transportador de solutos de la familia 17 miembro 4 (). El análisis de enriquecimiento de ontología genética (GO) destacó la vía de unión del complejo proteico MHC clase II como la más significativa para los rasgos inmunológicos. Estos hallazgos ofrecen valiosos conocimientos para la cría de cerdos resistentes a enfermedades y para comprender los rasgos relacionados con la inmunidad tanto en cerdos como potencialmente en humanos.
Descripción
Se realizó un estudio de asociación a nivel genómico (GWAS) en 489 cerdos F2 de un cruce entre verracos Large White y cerdas Min, centrándose en parámetros hematológicos y subpoblaciones de linfocitos T (17 rasgos). Utilizando el Illumina PorcineSNP60 Genotyping BeadChip, se identificaron loci SNP significativos, particularmente en el cromosoma 7 (SSC7) para el recuento de plaquetas (PLT) y el hematocrito de plaquetas (PCT), con el receptor metabotrópico de glutamato 4 () como gen candidato para PLT. El recuento de glóbulos blancos (WBC) mostró una asociación significativa con SSC12. Para los rasgos de linfocitos T, se encontraron señales significativas en SSC7, SSC2 y SSC5, con genes candidatos que incluyen, canal intracelular de cloruro 5 (), motivo tripartito que contiene 15 () y transportador de solutos de la familia 17 miembro 4 (). El análisis de enriquecimiento de ontología genética (GO) destacó la vía de unión del complejo proteico MHC clase II como la más significativa para los rasgos inmunológicos. Estos hallazgos ofrecen valiosos conocimientos para la cría de cerdos resistentes a enfermedades y para comprender los rasgos relacionados con la inmunidad tanto en cerdos como potencialmente en humanos.