La contaminación del suelo por metales pesados es una seria preocupación ambiental a nivel global. El cromo hexavalente (VI) es uno de los principales contaminantes que causan la contaminación del agua subterránea y del suelo por metales pesados. es una especie de pasto perenne C4 con un alto nivel de tolerancia a metales pesados. Esta especie puede eliminar eficazmente el cromo del suelo y mantener una producción de biomasa deseable bajo estrés por cromo. Esta investigación tuvo como objetivo caracterizar y comparar la acumulación de cromo en 58 genotipos de y desarrollar marcadores de Expressed Sequence Tag-Simple Sequence Repeat (EST-SSR) asociados con la tolerancia al cromo. Los resultados muestran que el patrón de translocación de cromo en las plantas difirió entre los 58 genotipos después del tratamiento con 200 mg/L de cromo; sin embargo, en la mayoría de los genotipos, el cromo se acumuló principalmente en las raíces. Se identificaron un total de 43,367 EST-SSRs, y se seleccionaron 88 pares de cebadores EST-SSR correspondientes a genes candidatos involucrados en la acumulación de cromo en para su validación. Posteriormente, 170 loci polimórficos generados a partir de 24 EST-SSRs validados se utilizaron para el análisis de la estructura de la población y la asociación genotipo-fenotipo. Basado en un modelo lineal general (GLM), se identificaron un total de 46 asociaciones ( < 0.05), con 14 marcadores EST-SSRs asociados con rasgos específicos. Entre ellos, se identificaron cuatro genes relacionados con transportadores ABC, cinasas de receptores asociados a la pared, así como dos transportadores de sulfato de alta afinidad (ST), bajo estrés por cromo ( < 0.05). Los resultados de este estudio ayudan a acelerar la selección de genotipos con rasgos deseables bajo estrés por cromo y proporcionan una plataforma para la mejora genética y la cría asistida por marcadores moleculares.