Las alfa-queratinas son proteínas estructurales en la corteza de las fibras de lana y se ensamblan de manera organizada en filamentos intermedios de queratina. La variación en estas proteínas de queratina afecta la estructura y características de la fibra de lana, lo que hace que los genes de queratina sean candidatos ideales para el desarrollo de marcadores genéticos que describan variaciones en los rasgos de la lana. Se investigó una región que abarca el exón 3-4 (incluyendo todo el exón 3, el intrón 3, el exón 4 y parte del intrón 4). Se observaron dos patrones de bandas que definen dos secuencias variantes, y estas se caracterizaron por la presencia de dos polimorfismos de un solo nucleótido. Se investigó el efecto de esta variación en la región del exón 3-4 sobre los rasgos de la lana en 463 corderos de cruce Merino x Southdown. Las frecuencias de estas dos variantes en estas ovejas fueron del 55.6% y 44.4%, respectivamente. Se observaron tres genotipos diferentes con frecuencias del 32.6%, 46.1% y 21.3% para las variantes, respectivamente. La presencia de una variante se asoció con un aumento en el peso de la lana sucia y el peso de la lana limpia, mientras que la presencia de la otra variante se asoció con un aumento en el factor de picazón de la lana. Estos hallazgos deberían replicarse en una gama más amplia de razas de ovejas para determinar si las asociaciones son robustas y para aclarar si los efectos observados son atribuibles a diferencias de raza o a los efectos de los propios genes.