Objetivo: El objetivo del presente estudio fue analizar la variación vertical de la comunidad fitoplanctónica en un lago costero subtropical y verificar la variación temporal de esta comunidad en relación con los cambios en la temperatura y las concentraciones de nitrógeno y fósforo disueltos.

Métodos: El muestreo de fitoplancton y de variables abióticas se realizó mensualmente desde junio de 2009 hasta enero de 2011 en cuatro profundidades de la parte central del lago Peri. Los datos se analizaron mediante análisis de varianza, correlación y análisis de correspondencia canónica.

Resultados: No se detectaron variaciones verticales en la comunidad fitoplanctónica ni en los datos limnológicos, pero sí se observó variación temporal. El lago presentó limitación por luz y nutrientes, y esta limitación lumínica favoreció a las especies de cianobacterias pertenecientes a los grupos funcionales Sn y S1. La comunidad fitoplanctónica estuvo compuesta por cinco grupos, con 31 taxones de agua dulce, en los que las Cianobacterias fueron las más importantes con un 87,7 % de la densidad total, seguidas por Chlorophyta con un 11,8 %. Cylindrospermopsis raciborskii fue dominante durante casi todo el período de estudio; cuando aumentaron la temperatura y el fósforo y disminuyó la velocidad del viento, la densidad de Limnothrix sp. se incrementó. Las distintas especies de cianobacterias filamentosas mostraron correlaciones diferentes con las variables, lo que indica que algunas especies pueden coexistir, cada una con nichos distintos, o competir por el mismo recurso.

Conclusión: El fitoplancton presentó una periodicidad determinada por los cambios anuales en la temperatura del agua y la disponibilidad de nutrientes. Las características del lago Peri favorecen la existencia de una columna de agua verticalmente homogénea y la dominancia de grupos funcionales de cianobacterias adaptados a baja luz subacuática y deficiencia de nutrientes.