El trabajo tuvo como objetivo mostrar las variaciones en la composición y estructura de la comunidad fitoplanctónica durante la pleamar y la bajamar en las Cataratas del Iguazú y el río Iguazú, y examinar la influencia de estas cataratas y las variables ambientales en la comunidad. Se tomaron muestras de fitoplancton mensualmente durante un año en dos estaciones de muestreo del río Iguazú. Se identificaron 408 taxones, siendo Bacillariophyceae el grupo con mayor representación. Se observó una gran diferenciación en la composición del fitoplancton entre las estaciones de muestreo. La riqueza y densidad total de los grupos fitoplanctónicos fue muy baja en ambas ubicaciones de muestreo, así como el índice de diversidad de Shannon, pero el valor de uniformidad fue generalmente alto. No se observaron diferencias estacionales ni espaciales significativas en las características estudiadas de la comunidad fitoplanctónica. Sin embargo, se observaron diferencias estacionales significativas al evaluar por separado la densidad y la riqueza de las clases de algas. La heterogeneidad de las características del río Iguazú entre los sitios de muestreo no provocó una diferenciación espacial significativa en las características de la comunidad fitoplanctónica. Sin embargo, la variación estacional de las condiciones climáticas ha influido significativamente en la composición y estructura de la comunidad del río Iguazú.