Las manzanas son una fruta popular en todo el mundo, con muchos beneficios para la salud y la nutrición. Sin embargo, esta fruta también está entre aquellas que, particularmente en Europa Central y del Norte, son alergénicas debido al alérgeno Mal d 1. Mal d 1 es un alérgeno homólogo a Bet v 1, el principal alérgeno de polen de abedul. En este estudio, se utilizaron dos enfoques diferentes para identificar el polimorfismo de longitud natural de los homólogos de Bet v 1 en variedades de manzana, con el objetivo de caracterizar su efectividad. Los perfiles de BBAP (polimorfismo amplificado basado en Bet v 1) y RFLP (polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción) fueron caracterizados y comparados. El análisis de RFLP reconoce la diversidad genética de las secuencias de Mal d 1 a un nivel relativamente bajo. En los perfiles de BBAP, la disimilitud genética fue de hasta el 50%, lo que parece adecuado para la identificación intraespecífica y sirve como un método adicional para el análisis de RFLP. El análisis de RFLP pudo distinguir algunas variedades que BBAP no pudo, como Sonet.