Los genes de resistencia de las plantas (genes R) impulsan las respuestas inmunes de los cultivos contra patotipos específicos de organismos causantes de enfermedades. Con el tiempo, ha surgido diversidad genética en los genes R y los pseudogenes R entre las diferentes variedades de arroz. Este estudio de bioinformática se llevó a cabo para (i) predecir los conjuntos completos de genes R candidatos del tipo sitio de unión de nucleótidos con repeticiones ricas en leucina (NLR) presentes en seis genomas de arroz; (ii) detectar variaciones dentro de los genes R candidatos; (iii) identificar marcadores seleccionables potenciales dentro y cerca de los genes LRR entre 75 genomas diversos de arroz. Cuatro genomas de alta calidad, más los genomas estándar y de referencia, fueron analizados con herramientas bioinformáticas ampliamente disponibles para identificar genes R candidatos y pseudogenes R. Fueron detectados en grupos, consistentes con estudios anteriores. El análisis BLAST de secuencias de proteínas clonadas de 31 loci de genes R dio confianza en este enfoque para la detección de genes R NLR clonados. Aproximadamente el 10% de los genes R candidatos estaban ubicados dentro de 1 kb de un marcador de microsatélite (SSR). Las comparaciones de secuencias entre los genomas de arroz detectaron SNPs o InDels en 334 genes R candidatos de arroz. Hubo significativamente más SNPs e InDels dentro de los genes R candidatos NLR identificados que en otros tipos de genes. Las ubicaciones a nivel genómico de los genes R candidatos y sus marcadores asociados se presentan aquí para el potencial desarrollo futuro de variedades mejoradas resistentes a enfermedades. Se discuten las limitaciones de los enfoques in silico utilizados para el descubrimiento de genes R.