Validación de marcadores moleculares de loci de resistencia a la mancha neta de cebada en el cromosoma 3H para selección asistida por marcadores
Autores: Afanasenko, Olga; Rozanova, Irina; Gofman, Anastasiia; Lashina, Nina; Novakazi, Fluturë; Mironenko, Nina; Baranova, Olga; Zubkovich, Alexandr
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Validación de marcadores moleculares de loci de resistencia a la mancha neta de cebada en el cromosoma 3H para selección asistida por marcadores
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas Generales
Palabras clave
Enfermedad
Cebada
Resistencia
Marcadores
Cromosoma
Cultivares
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 23
Citaciones: Sin citaciones
La enfermedad más extendida y perjudicial de la cebada es la forma de red de mancha foliar causada por el ascomiceto f. Drechsler. Una estrategia rentable y sostenible para proteger la cebada contra es desarrollar cultivares de cebada con resistencia genética. En un análisis previo de GWA, identificamos marcadores de SNP asociados con un locus de resistencia en el cromosoma 3H en el intervalo de 45.82-54.53 cM. El objetivo del estudio era validar los marcadores de QTL que controlan la resistencia a en el cromosoma 3H en esta región mediante genotipado KASP en cuatro poblaciones F de cruces entre los cultivares resistentes, Morex, Fox y Zolo, y el acceso, Local k-21578, con la cebada cv. Gesine y en una población de haploides dobles (DH) de Canadian Lake Shore (CLS)/Harrington. Once de quince marcadores estudiados mostraron una alta eficacia (97.5-100%) para la cosegregación con la resistencia a en la población DH, CLS/Harrington. Tres de estos marcadores ubicados en 54.53 cM y uno en 51.27 cM fueron efectivos en dos poblaciones F de cruces de Morex y Fox con la cv. Gesine susceptible. Estos marcadores también están ubicados cerca uno del otro en el mapa físico (442,203,921-443,119,491 pb). Aparentemente, en los cultivares CLS, Morex y Fox, la resistencia a está determinada por el mismo locus. Los marcadores JHI-Hv50k-2016-166392 (47.1 cM, 112,536,071 pb), Clone ID 3255462_1 (51.63 cM, 363,531,898 pb) y Clone ID 3255462_2 (51.63 cM, 363,531,871 pb) mostraron una alta eficacia en la población DH y en la población F, Local k-21578/Gesine. Aparentemente, existen al menos dos loci que controlan la resistencia en la región cromosómica de 47.0-54.3 cM: uno en 46.0-48.44 cM y otro en 51.27-54.8 cM. Se encontró que estas regiones albergan varios genes involucrados en funciones importantes de la planta, incluidas las respuestas a enfermedades y las vías de señalización. Se desarrollaron marcadores de PCR específicos de alelo basados en los datos del ensayo KASP y se probaron en seis genotipos de cebada resistentes, dos moderadamente resistentes y dos susceptibles. Cuatro marcadores resultaron efectivos para diferenciar genotipos de cebada susceptibles y resistentes. Los marcadores KASP y de PCR específicos de alelo asociados con la resistencia en el cromosoma 3H serán útiles para la piramidación de QTLs de resistencia en la selección asistida por marcadores de cebada.
Descripción
La enfermedad más extendida y perjudicial de la cebada es la forma de red de mancha foliar causada por el ascomiceto f. Drechsler. Una estrategia rentable y sostenible para proteger la cebada contra es desarrollar cultivares de cebada con resistencia genética. En un análisis previo de GWA, identificamos marcadores de SNP asociados con un locus de resistencia en el cromosoma 3H en el intervalo de 45.82-54.53 cM. El objetivo del estudio era validar los marcadores de QTL que controlan la resistencia a en el cromosoma 3H en esta región mediante genotipado KASP en cuatro poblaciones F de cruces entre los cultivares resistentes, Morex, Fox y Zolo, y el acceso, Local k-21578, con la cebada cv. Gesine y en una población de haploides dobles (DH) de Canadian Lake Shore (CLS)/Harrington. Once de quince marcadores estudiados mostraron una alta eficacia (97.5-100%) para la cosegregación con la resistencia a en la población DH, CLS/Harrington. Tres de estos marcadores ubicados en 54.53 cM y uno en 51.27 cM fueron efectivos en dos poblaciones F de cruces de Morex y Fox con la cv. Gesine susceptible. Estos marcadores también están ubicados cerca uno del otro en el mapa físico (442,203,921-443,119,491 pb). Aparentemente, en los cultivares CLS, Morex y Fox, la resistencia a está determinada por el mismo locus. Los marcadores JHI-Hv50k-2016-166392 (47.1 cM, 112,536,071 pb), Clone ID 3255462_1 (51.63 cM, 363,531,898 pb) y Clone ID 3255462_2 (51.63 cM, 363,531,871 pb) mostraron una alta eficacia en la población DH y en la población F, Local k-21578/Gesine. Aparentemente, existen al menos dos loci que controlan la resistencia en la región cromosómica de 47.0-54.3 cM: uno en 46.0-48.44 cM y otro en 51.27-54.8 cM. Se encontró que estas regiones albergan varios genes involucrados en funciones importantes de la planta, incluidas las respuestas a enfermedades y las vías de señalización. Se desarrollaron marcadores de PCR específicos de alelo basados en los datos del ensayo KASP y se probaron en seis genotipos de cebada resistentes, dos moderadamente resistentes y dos susceptibles. Cuatro marcadores resultaron efectivos para diferenciar genotipos de cebada susceptibles y resistentes. Los marcadores KASP y de PCR específicos de alelo asociados con la resistencia en el cromosoma 3H serán útiles para la piramidación de QTLs de resistencia en la selección asistida por marcadores de cebada.