El virus del mosaico rayado del maíz (MSV) es responsable de la enfermedad del mosaico rayado del maíz y representa una seria amenaza para la producción de maíz en África subsahariana. La resistencia poligénica al MSV se ha convertido en un requisito esencial en los cultivares modernos de maíz para mitigar las pérdidas de rendimiento. Muchos marcadores de polimorfismos de nucleótido único (SNP) vinculados a loci de resistencia putativos al MSV han sido identificados para su uso en la cría hacia adelante. Este estudio tuvo como objetivo validar, utilizando el ensayo de PCR de alelo específico kompetitivo de alto rendimiento (KASP), la capacidad diagnóstica de los tres marcadores de SNP vinculados a los loci para el rasgo de resistencia en 151 líneas endocriadas de generaciones tempranas con diversos antecedentes genéticos, junto con nueve líneas élite resistentes al MSV y un control susceptible (cv. Pool-16). Las respuestas fenotípicas fueron determinadas por inoculación de MSV utilizando saltahojas virulíferos () en condiciones de invernadero. Basándose en un sistema de calificación de enfermedades de MSV establecido, las líneas de maíz fueron categorizadas en resistentes, moderadamente resistentes, susceptibles y altamente susceptibles. Los tres SNPs asociados con la resistencia al MSV fueron detectados en 133 líneas, que fueron categorizadas como resistentes (54), moderadamente resistentes (76) y susceptibles (1). Las 18 líneas de generaciones tempranas sin estos SNPs fueron clasificadas como moderadamente resistentes (10), susceptibles (5) y altamente susceptibles (3). Este estudio confirma la fuerte asociación de los SNPs con la resistencia al MSV y su utilidad para la cría hacia adelante en maíz, al tiempo que enfatiza la necesidad de identificar marcadores adicionales para seleccionar líneas con resistencia al MSV sin ambigüedad.