El bienestar de los cetáceos en libertad se está viendo afectado en todo el mundo debido a actividades humanas como la pesca comercial y el tráfico marítimo. Aquí, validamos un indicador físico no invasivo del bienestar para las ballenas jorobadas y las ballenas de aleta que se encuentran en el Golfo de San Lorenzo, Canadá. La medición del bienestar a múltiples escalas mostró que la mayoría de las ballenas jorobadas se encontraban en un buen estado de bienestar, mientras que la mayoría de las ballenas de aleta estaban en un estado moderado. Para ambas especies, el bienestar se vio principalmente afectado por los efectos prolongados de trauma físico (enredos en artes de pesca y colisiones con barcos) en la condición corporal, específicamente ballenas más delgadas. Otros factores que impactan el bienestar incluyeron la degradación del medio marino (por ejemplo, niveles de oxígeno, temperaturas del agua y niveles de salinidad).