El impacto de la vacunación en la dinámica de transmisión de la enfermedad de mano, pie y boca (HFMD) se explora en este documento, considerando un sistema de ecuaciones con derivadas de orden fraccionario. Este modelo proporciona estrategias de vacunación y caracteriza la estabilidad local y global utilizando funciones de Lyapunov. Este trabajo calcula el número básico de reproducción () para representar los escenarios endémicos y epidémicos. Además, se realizó un análisis de sensibilidad para identificar los parámetros más críticos responsables de la propagación de la enfermedad. Nuestros resultados indican que la vacunación juega un papel crucial en el control de la HFMD, reduciendo significativamente su prevalencia. Estos hallazgos coinciden con investigaciones existentes, respaldando la importancia de estrategias de vacunación efectivas e intervenciones de salud pública contra la HFMD. El modelo de orden fraccionario captura el efecto de memoria en la dinámica de enfermedades infecciosas, proporcionando una mayor comprensión en la modelización de la transmisión de la HFMD en comparación con un modelo de orden entero tradicional. Los resultados contribuirían a estrategias efectivas de vacunación e intervenciones de salud pública contra la HFMD.