Las células madre mesenquimales (MSC) son atractivas en varios campos de la medicina regenerativa debido a su potencial terapéutico y propiedades únicas y complejas. La investigación básica de células madre y la pandemia global de COVID-19 han dado ímpetu al desarrollo de terapias celulares para enfermedades infecciosas. El objetivo de esta revisión fue sistematizar datos científicos sobre las aplicaciones de células madre mesenquimales (MSC) y vesículas extracelulares derivadas de MSC (MSC-EVs) en el tratamiento combinado de enfermedades infecciosas. La aplicación de MSC y MSC-EVs en el tratamiento de enfermedades infecciosas tiene efectos inmunomoduladores, antiinflamatorios y antibacterianos, y también promueve la restauración del epitelio y estimula la regeneración de tejidos. El uso de MSC-EVs es una estrategia prometedora de tratamiento sin células que permite resolver los problemas asociados con la seguridad de la terapia celular y aumentar su efectividad. En esta revisión, se presentan datos experimentales y ensayos clínicos basados en MSC y MSC-EVs para el tratamiento de enfermedades infecciosas. Las MSC y MSC-EVs pueden ser una herramienta prometedora para el tratamiento de diversas enfermedades infecciosas, especialmente en combinación con medicamentos antivirales. El empleo de EVs derivadas de MSC representa una estrategia más prometedora para el tratamiento sin células, demostrando un alto potencial terapéutico en estudios preclínicos.