El sistema estuarino de Charleston (CESS) de los delfines mulares de Tamanend (Tursiops erebennus) exhibe fidelidad a largo plazo al puerto de Charleston y a los ríos Ashley, Cooper y Wando en Charleston, Carolina del Sur, EE. UU. En el río Cooper, los delfines han sido avistados de manera irregular en las regiones superiores donde los niveles de salinidad están por debajo de lo que se considera un hábitat preferido para los delfines. Realizamos encuestas con sistemas aéreos no tripulados (UAS) en regiones de alta salinidad (>15 partes por mil) y baja salinidad (<15 partes por mil) (n = 8 sitios) del río Cooper y aguas circundantes para evaluar la distribución de los delfines en términos de presencia/ausencia, tasa de detección, abundancia y densidad. También evaluamos la influencia de factores ecológicos (salinidad, temperatura del agua, estación y disponibilidad de presas) en la distribución de los delfines. Se detectaron delfines en cinco sitios, siendo la salinidad más alta y la temperatura del agua predictores significativos de presencia y abundancia. Los delfines fueron detectados durante todo el año en sitios de alta salinidad y fueron detectados con poca frecuencia en sitios de baja salinidad durante los meses con temperaturas del agua más cálidas. Los resultados de este estudio contribuyen a la comprensión general de la distribución de los delfines en diversos hábitats dentro del sistema estuarino de Charleston y los posibles factores que impulsan su movimiento hacia aguas de baja salinidad.