El maíz (Zea mays) es el cultivo de cereal más productivo del mundo, sin embargo, está amenazado por varias enfermedades. Entre ellas, la pudrición del tallo por Fusarium (FSR) causa una pérdida de rendimiento global promedio del 4.5%. Las micotoxinas deoxinivalenol, zearalenona, fumonisinas y moniliformina persisten en el grano y en el silo después de la cosecha y representan un riesgo para la salud humana y animal. Esta revisión describe el estilo de vida de los patógenos fúngicos que causan FSR, estudia cómo optimizar la evaluación de resistencia, identifica loci de rasgos cuantitativos (QTL) y genes candidatos (CG), y, finalmente, considera los métodos para seleccionar resistencia a FSR, especialmente a través de la selección genómica. Para evaluar genotipos de maíz en busca de resistencia a FSR, se han empleado varios métodos de inoculación artificial en la mayoría de los estudios, incluyendo la inserción de palillos, pellets de bolas, infección de raíces y el método del grano de avena. Sin embargo, estos métodos tienen varias limitaciones para inducir efectivamente la infección por FSR. Se recomienda la inyección de aguja de inóculo en el tallo, especialmente cuando se combina con una escala cuantitativa o porcentual, ya que fenotipa efectivamente las poblaciones de maíz para la resistencia a FSR. Nueve estudios con poblaciones más grandes (>=150 progenies) investigaron la arquitectura genética de la resistencia a FSR. La herencia es claramente cuantitativa. Se informan cuatro QTL principales y varios QTL menores que confieren resistencia a los patógenos de FSR, y se han identificado algunos CG. Se recomienda la selección genómica como un método efectivo para desarrollar maíz resistente a FSR de manera rutinaria, pero solo dos estudios han explorado esta área. Un análisis ómico (proteómica, transcriptómica y metabolómica) de la expresión de los genes candidatos debería validar su papel en la resistencia a FSR, y su uso podría acelerar la selección.