Los micromamíferos no voladores son organismos capaces de proporcionar información precisa sobre la riqueza, abundancia y variaciones en la composición de especies relacionadas con el uso de hábitats. El objetivo de esta investigación fue comparar estas variaciones en el Cerrado en sentido estricto, el Palmar, el Bosque de Galería y el Campo Rocoso. De mayo de 1999 a febrero de 2000, realizamos un censo de micromamíferos no voladores (y, por lo tanto, micromamíferos) en la Estación Ecológica Serra das Araras. Capturamos 218 individuos y recapturamos 62, pertenecientes a 21 taxones, 13 roedores y ocho marsupiales, en un total de 13.200 noches de trampa. El éxito de captura fue del 1,7 %. Observamos una mayor riqueza de micromamíferos en las zonas boscosas (Bosque de Galería y Palmar) que en las zonas abiertas (Campo Rocoso y Cerrado en sentido estricto). El Palmar presentó la mayor riqueza de marsupiales, posiblemente debido a la calidad de un nicho específico. El Campo Rocoso presentó la menor riqueza, pero con una abundancia muy alta de pocas especies, principalmente Thrichomys pachyurus y Monodelphis domestica. Los hábitats forestales presentaron una composición de especies similar. Los hábitats abiertos, Cerrado sensu stricto y Campo Rocoso, presentaron una composición de especies distinta entre sí, y también en comparación con las áreas boscosas. Diferentes especies son exclusivas o mostraron preferencia por hábitats específicos. La protección de biomas horizontalmente heterogéneos, como el Cerrado, es fundamental para el mantenimiento de la diversidad regional de la comunidad de micromamíferos del centro de Brasil.