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Usando el principio de máxima entropía para combinar simulaciones y experimentos de solución

Autores: Cesari, Andrea; Reißer, Sabine; Bussi, Giovanni

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2018

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Acceso abierto

Artículo científico
2018

Usando el principio de máxima entropía para combinar simulaciones y experimentos de solución


Categoría

Ingeniería y Tecnología

Subcategoría

Ingeniería de Sistemas

Palabras clave

Dinámica molecular
Simulaciones
Sistemas biomoleculares
Campos de fuerza empíricos
Datos experimentales
Principio de máxima entropía

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 20

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Las simulaciones de dinámica molecular (MD) permiten la investigación de la dinámica estructural de sistemas biomoleculares con una resolución temporal y espacial incomparable. Sin embargo, para compensar las inexactitudes de los campos de fuerza empíricos utilizados, está volviéndose común integrar las simulaciones de MD con datos experimentales obtenidos de mediciones en conjunto. Aquí revisamos los enfoques que pueden ser utilizados para combinar MD y experimentos bajo la guía del principio de máxima entropía. Nos enfocamos principalmente en métodos basados en multiplicadores de Lagrange, ya sea implementados como reponderación de simulaciones existentes o a través de una optimización en tiempo real. Discutimos cómo los errores en los datos experimentales pueden ser modelados y tenidos en cuenta. Finalmente, utilizamos sistemas modelo simples para ilustrar las dificultades típicas que surgen al aplicar estos métodos.

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