La disponibilidad dinámica de nutrientes y la densidad de flujo de fotones en los hábitats de diatomeas requieren capacidades de amortiguación para mantener la homeostasis metabólica. Esto se logra mediante la biosíntesis y el recambio de lípidos de almacenamiento, que se almacenan en gotas lipídicas (GLs). Las GLs son un orgánulo conservado entre los eucariotas, compuesto por un núcleo lipídico neutro rodeado por una monocapa de lípidos polares. Las GLs protegen el entorno intracelular de la acumulación de compuestos hidrofóbicos y funcionan como un sumidero de carbono y electrones. Estas funciones se implementan mediante interconexiones con otros sistemas intracelulares, incluyendo la fotosíntesis y la autofagia. Dado que la producción de lípidos en diatomeas puede ser un objetivo prometedor para la explotación biotecnológica, una comprensión más profunda de las GLs puede ofrecer objetivos para la ingeniería metabólica. En esta revisión, proporcionamos una visión general de la biología de las GLs en diatomeas y su potencial biotecnológico.