Una revisión de genes y vías candidatas en la preeclampsia: un análisis bioinformático integrado
Autores: Mohamad, Muhammad Aliff; Mohd Manzor, Nur Fariha; Zulkifli, Noor Fadzilah; Zainal, Nurzaireena; Hayati, Abd Rahman; Ahmad Asnawi, Asral Wirda
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2020
Acceso abierto
Artículo científico
2020
Una revisión de genes y vías candidatas en la preeclampsia: un análisis bioinformático integrado
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Preeclampsia
Genes
Placenta
Embarazo
Secuenciación
Biomarcadores
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 18
Citaciones: Sin citaciones
La preeclampsia es un trastorno específico del embarazo caracterizado por la presencia de hipertensión con el inicio de proteinuria, disfunción orgánica materna o disfunción uteroplacentaria. La preeclampsia es una de las principales causas de mortalidad y morbilidad materna y fetal en todo el mundo. Sin embargo, las etiopatologías de la preeclampsia no se comprenden completamente. Muchos estudios han indicado que los genes se expresan de manera diferencial entre el estado normal y el estado de enfermedad. Por lo tanto, este estudio buscó sistemáticamente en la literatura sobre la expresión génica humana que se expresó de manera diferencial en la preeclampsia. Se realizó una búsqueda electrónica hasta 2019 a través de PubMed, Scopus, Ovid-Medline y Gene Expression Omnibus, donde se utilizaron los siguientes términos MeSH (Medical Subject Heading) que se especificaron como el enfoque principal de los artículos: Gen, placenta, preeclampsia y embarazo en el título o resumen. También encontramos términos MeSH adicionales a través de la Biblioteca Cochrane: Transcripción, secuenciación y perfilado. De 687 estudios recuperados de la búsqueda, solo se incluyeron publicaciones originales que habían realizado secuenciación de alto rendimiento de tejidos placentarios humanos que informaron sobre genes expresados de manera diferencial en embarazos con preeclampsia. Dos revisores examinaron de manera independiente los títulos y resúmenes antes de examinar la elegibilidad de los estudios que cumplían con los criterios de inclusión. Para cada estudio, se identificaron el diseño del estudio, el tamaño de la muestra, el tipo de muestreo y el método de análisis de genes. Los genes enumerados se analizaron más a fondo con DAVID, STRING y Cytoscape MCODE. Se incluyeron tres artículos de investigación originales que involucraban la preeclampsia que comprendían los conjuntos de datos en la expresión génica. Al combinar tres estudios, se produjeron 250 genes expresados de manera diferencial con un nivel de significancia de < 0.05. Identificamos genes candidatos: LEP, NRIP1, SASH1 y ZADHHC8P1. A través del análisis GO, encontramos la organización de la matriz extracelular como la ontología enriquecida altamente significativa en un grupo de genes regulados al alza y el proceso inmune en genes regulados a la baja. Los estudios a nivel genético tienen el potencial de proporcionar nuevas perspectivas sobre la regulación y ampliar la base para la identificación de cambios en el mecanismo de la preeclampsia. La bioinformática integrada podría identificar genes expresados de manera diferencial que podrían ser genes candidatos y vías potenciales en la preeclampsia que podrían mejorar nuestra comprensión de la causa y los mecanismos moleculares subyacentes que podrían utilizarse como biomarcadores potenciales para la estratificación del riesgo y el tratamiento.
Descripción
La preeclampsia es un trastorno específico del embarazo caracterizado por la presencia de hipertensión con el inicio de proteinuria, disfunción orgánica materna o disfunción uteroplacentaria. La preeclampsia es una de las principales causas de mortalidad y morbilidad materna y fetal en todo el mundo. Sin embargo, las etiopatologías de la preeclampsia no se comprenden completamente. Muchos estudios han indicado que los genes se expresan de manera diferencial entre el estado normal y el estado de enfermedad. Por lo tanto, este estudio buscó sistemáticamente en la literatura sobre la expresión génica humana que se expresó de manera diferencial en la preeclampsia. Se realizó una búsqueda electrónica hasta 2019 a través de PubMed, Scopus, Ovid-Medline y Gene Expression Omnibus, donde se utilizaron los siguientes términos MeSH (Medical Subject Heading) que se especificaron como el enfoque principal de los artículos: Gen, placenta, preeclampsia y embarazo en el título o resumen. También encontramos términos MeSH adicionales a través de la Biblioteca Cochrane: Transcripción, secuenciación y perfilado. De 687 estudios recuperados de la búsqueda, solo se incluyeron publicaciones originales que habían realizado secuenciación de alto rendimiento de tejidos placentarios humanos que informaron sobre genes expresados de manera diferencial en embarazos con preeclampsia. Dos revisores examinaron de manera independiente los títulos y resúmenes antes de examinar la elegibilidad de los estudios que cumplían con los criterios de inclusión. Para cada estudio, se identificaron el diseño del estudio, el tamaño de la muestra, el tipo de muestreo y el método de análisis de genes. Los genes enumerados se analizaron más a fondo con DAVID, STRING y Cytoscape MCODE. Se incluyeron tres artículos de investigación originales que involucraban la preeclampsia que comprendían los conjuntos de datos en la expresión génica. Al combinar tres estudios, se produjeron 250 genes expresados de manera diferencial con un nivel de significancia de < 0.05. Identificamos genes candidatos: LEP, NRIP1, SASH1 y ZADHHC8P1. A través del análisis GO, encontramos la organización de la matriz extracelular como la ontología enriquecida altamente significativa en un grupo de genes regulados al alza y el proceso inmune en genes regulados a la baja. Los estudios a nivel genético tienen el potencial de proporcionar nuevas perspectivas sobre la regulación y ampliar la base para la identificación de cambios en el mecanismo de la preeclampsia. La bioinformática integrada podría identificar genes expresados de manera diferencial que podrían ser genes candidatos y vías potenciales en la preeclampsia que podrían mejorar nuestra comprensión de la causa y los mecanismos moleculares subyacentes que podrían utilizarse como biomarcadores potenciales para la estratificación del riesgo y el tratamiento.