Además de aumentar el rendimiento de los granos, la mejora de la calidad del arroz (L.) ha recibido una atención creciente recientemente. La calidad de cocción y de consumo (CEQ) es un indicador importante de la calidad del arroz. La opacidad y el endospermo harinoso tienen un impacto significativo en la CEQ del arroz, lo que resulta en cambios notables. Debido al fenotipo fácilmente observable del endospermo harinoso, la clonación de mutaciones génicas únicas que causan endospermo harinoso y la evaluación indirecta de cambios en las CEQ facilitan la exploración de genes menores que controlan la CEQ. En este estudio, se obtuvo una variante alélica genética estable de , llamada , a través de la mutagénesis con EMS. La variante alélica lleva la mutación. mostró una reducción significativa en los gránulos de almidón compuesto y un aumento significativo en los gránulos de almidón simples en las células del endospermo, lo que indica la participación de en la síntesis de almidón del endospermo. Además, mostró una disminución significativa en la consistencia del gel (GC) en comparación con el tipo salvaje. A través del análisis de los datos de GC de 166 recursos genéticos de arroz, se encontró una variación C-T en el 18º exón de cy que resultó ser un sitio crucial, causando una diferencia significativa en el GC entre el arroz índica y japonica. Este locus puede ser utilizado en el futuro para desarrollar marcadores moleculares para la cría asistida por marcadores moleculares. Este estudio proporciona una buena base de investigación para mejorar la CEQ del arroz.