Un sistema de cultivo de microbrotes de plantas in vitro compuesto por dos fases; una fase líquida cubierta por una fase sólida flotante, que se describe en detalle en este documento. Este sistema está diseñado para permitir la extracción de compuestos naturales liberados/difundidos en la fase líquida durante el crecimiento de las raíces, facilitando así su procesamiento y caracterización bioquímica. La fase sólida mantiene la planta a flote y permite el cultivo simultáneo de un microorganismo, evitando su penetración en la fase líquida, donde las raíces están sumergidas. Ambas fases pueden formularse de forma independiente según sea necesario para la optimización del crecimiento de ambos organismos. Teniendo en cuenta el sistema cerrado y las variables conocidas descritas en esta patente, las aplicaciones del método descrito incluyen pruebas con pesticidas, herbicidas y otros productos similares.