Los protocolos de evaluación del bienestar animal son importantes para identificar problemas de bienestar en programas de conservación. Este estudio tuvo como objetivo desarrollar un protocolo de bienestar básico para la evaluación del bienestar de los huemules patagónicos en centros de conservación. Este protocolo se basa en el marco de Calidad de Bienestar (WQ) para el ganado y se desarrolló teniendo en cuenta la investigación disponible sobre los comportamientos, la ecología, la conservación y la gestión en cautiverio de esta especie, así como los protocolos de evaluación del bienestar para otras especies de ungulados. Como resultado, el protocolo se desarrolló específicamente para los huemules patagónicos e incluyó cuatro principios, 12 criterios y 23 indicadores basados en el animal y los recursos. Los doce criterios del protocolo WQ se redujeron a nueve, y se añadieron tres nuevos criterios porque eran tanto factibles como esenciales para la evaluación del bienestar en huemules patagónicos en cautiverio. Este protocolo está destinado principalmente a identificar problemas de bienestar en especies en peligro de extinción en el contexto de centros de conservación (centros de reproducción, rescate, rehabilitación o tratamiento). Así, no se propuso la agregación de diferentes medidas para obtener una puntuación global. Sin embargo, se propuso un sistema de puntuación que asigna un valor en una escala de 0 a 2 (0 = sin preocupación por el bienestar; 1 = preocupación por el bienestar; 2 = preocupación urgente por el bienestar) para cada categoría. Aunque aún se necesita más investigación para validar completamente el protocolo, este es el primer desarrollo de un protocolo para evaluar el bienestar del huemul patagónico, y puede utilizarse como base para el desarrollo de protocolos de evaluación del bienestar para otras especies de ciervos en cautiverio.