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Un nuevo método de conjunto para detectar anomalías en matrices de expresión génica

Autores: Selicato, Laura; Esposito, Flavia; Gargano, Grazia; Vegliante, Maria Carmela; Opinto, Giuseppina; Zaccaria, Gian Maria; Ciavarella, Sabino; Guarini, Attilio; Del Buono, Nicoletta

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2021

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Acceso abierto

Artículo científico
2021

Un nuevo método de conjunto para detectar anomalías en matrices de expresión génica


Categoría

Matemáticas

Subcategoría

Matemáticas generales

Palabras clave

Anomalías
Valores atípicos
Datos de expresión génica
Análisis de microarreglos
Agrupamiento jerárquico
Análisis de componentes principales robustos

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 28

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Uno de los problemas principales en el análisis de datos reales está a menudo relacionado con la presencia de anomalías. Es decir, los casos anómalos pueden tanto estropear el análisis resultante como contener información valiosa al mismo tiempo. En ambos casos, la capacidad para detectar estas ocurrencias es muy importante. En el campo biomédico, una correcta identificación de los valores atípicos podría permitir el desarrollo de nuevas hipótesis biológicas que no se consideran al observar datos biológicos experimentales. En este trabajo, abordamos el problema de detectar valores atípicos en datos de expresión génica, centrándonos en el análisis de microarrays. Proponemos un enfoque de conjunto para detectar anomalías en matrices de expresión génica basado en el uso de Clustering Jerárquico y Análisis de Componentes Principales Robustos, lo que nos permite derivar una nueva clasificación pseudo-matemática de anomalías.

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