La conexión atornillada es un componente importante en la estructura mecánica que afecta significativamente la propiedad dinámica de toda la estructura. En este artículo, se propone un modelo de interfaz de transición tridimensional que contiene parámetros geométricos y físicos para modelar la unión atornillada basado en el análisis de contacto. Los parámetros geométricos y los parámetros físicos se utilizan para caracterizar la influencia del área de contacto y la presión de contacto, que están relacionados con parámetros de conexión como material, rugosidad, grosor de conexión y fuerza de apriete, respectivamente. Después de eso, se propone un método de identificación de parámetros geométricos, y se construye una base de datos de parámetros geométricos de uniones atornilladas para herramientas de máquina basada en el método de interpolación de Kriging. Luego, se propone un método de actualización del modelo basado en la combinación de parámetros modales y la función de respuesta en frecuencia para identificar los parámetros físicos y el grosor del modelo de interfaz de transición tridimensional. La base de datos del modelo de interfaz de transición se construye después de verificar la validez del modelo propuesto. Finalmente, se utiliza un ejemplo de ingeniería de una herramienta de grabado para comprobar la viabilidad del modelo de interfaz de transición propuesto y el uso de la base de datos de parámetros construida.