El nuevo concepto de Movilidad Aérea Urbana (UAM) y los vehículos aéreos no tripulados emergentes están recibiendo cada vez más atención por parte de varios interesados para implementar nuevas soluciones de transporte. Sin embargo, hay varios problemas que resolver para implementar sistemas UAM exitosos. En particular, establecer un marco adecuado es fundamental para incluir este nuevo sistema de transporte en los existentes, tanto los sistemas terrestres como los aéreos. La regulación y definición de redes aéreas, así como la caracterización de instalaciones terrestres (vertipuertos) para permitir que pasajeros y carga accedan a los servicios, están entre los temas más relevantes a discutir. Para identificar redes de transporte UAM, adecuadamente conectadas con servicios de transporte terrestre, se podrían adoptar modelos de gemelos digitales para apoyar la modelización y simulación de escenarios existentes y esperados con datos constantemente actualizados para identificar soluciones que aborden el diseño y la gestión de sistemas de transporte. En esta perspectiva, se presenta un modelo de gemelo digital aplicado a un contexto urbano existente, la ciudad de Bolonia, en el norte de Italia, en combinación con una nueva red de transporte aéreo que incluye la tercera dimensión. La Red Aérea Urbana 3D intenta satisfacer el principio de vincular puntos de origen/destino asegurando caminos aéreos seguros y separaciones adecuadas de vehículos aéreos. Involucra enlaces dinámicos innovadores impulsados por una función de costo heurística. Este trabajo proporciona el marco inicial para explorar la integración de los servicios UAM en contextos realistas, evitando los costos asociados con simulaciones de vuelo en la realidad. Además, puede ser utilizado para análisis holísticos de sistemas UAM.