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Un enfoque simplificado para el análisis de vías a partir de datos de ARN secuenciado

Autores: Bow, Austin

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2021

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Acceso abierto

Artículo científico
2021

Un enfoque simplificado para el análisis de vías a partir de datos de ARN secuenciado


Categoría

Ingeniería y Tecnología

Subcategoría

Bioingeniería

Palabras clave

Reducción
Secuenciación de ARN
Procesamiento de datos
Plataformas de software
Análisis de vías
Muestras

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 31

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La reducción de costos asociados con la realización de secuenciación de ARN ha impulsado un aumento en la aplicación de esta técnica analítica; sin embargo, los factores restrictivos asociados con esta herramienta ahora han pasado de las limitaciones presupuestarias al tiempo requerido para el procesamiento de datos. La escala pura de los datos crudos producidos puede presentar un desafío formidable para los investigadores que buscan extraer información vital sobre las muestras. Aunque muchas de las empresas que realizan secuenciación de ARN proporcionan un informe básico para las muestras enviadas, esto puede no capturar adecuadamente ciertas vías de interés para comparaciones de muestras. Para evaluar más a fondo estos datos, puede ser necesario utilizar diversas plataformas de software de enriquecimiento y mapeo para resaltar relaciones específicas. Con la amplia variedad de estas plataformas de software disponibles, esto también puede presentar una tarea desalentadora. La metodología descrita aquí tiene como objetivo permitir a los investigadores nuevos en el manejo de datos de secuenciación de ARN con un enfoque simplificado para el análisis de vías. Además, las plataformas de software implementadas están fácilmente disponibles y son gratuitas para utilizar, lo que hace que este enfoque sea viable, incluso para presupuestos restrictivos. Las tablas resultantes y las redes nodales proporcionarán información valiosa sobre las muestras y se pueden utilizar para generar gráficos de alta calidad para publicaciones y presentaciones.

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