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Un enfoque de aprendizaje profundo para medir la función visual en peces cebra

Autores: Patil, Manjiri; Birchall, Annabel; Syed, Hammad; Rodwell, Vanessa; Yoon, Ha-Jun; Norton, William H. J.; Thomas, Mervyn G.

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2025

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Acceso abierto

Artículo científico
2025

Un enfoque de aprendizaje profundo para medir la función visual en peces cebra


Categoría

Ciencias Naturales y Subdisciplinas

Subcategoría

Biología

Palabras clave

Reflejo optocinético
DeepLabCut
Movimientos oculares
Pez cebra
Enfermedades neurológicas
Enfermedades oculares

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 16

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
El ensayo del reflejo optocinético (OKR) es una herramienta valiosa para investigar aspectos de las enfermedades neurológicas y oculares humanas. Los pipelines de análisis de OKR tradicionales dependen de la binarización basada en el contraste o de software costoso y a menudo tienen dificultades en entornos de bajo contraste. Utilizamos DeepLabCut (DLC v2.3.9), un modelo robusto de seguimiento de objetos, en el pipeline de OKR para cuantificar con precisión los movimientos oculares larvales en peces cebra. Demostramos que la precisión del modelo DLC es comparable a otros métodos tradicionales con una fiabilidad superior, especialmente en diversas condiciones de iluminación, tanto en peces cebra de tipo salvaje como en mutantes hipopigmentados. La adaptabilidad de este pipeline sugiere su utilidad más allá de los comportamientos visuales, como en interacciones sociales y dinámicas depredador-presa, beneficiando aún más la investigación sobre modelos de enfermedades oculares y neurológicas.

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