La alga roja es un aditivo prometedor para la alimentación de rumiantes con propiedades anti-metagenogénicas que podría contribuir a las soluciones para el cambio climático global. La genómica ha proporcionado una base sólida para investigaciones moleculares en profundidad, incluida la proteómica. Aquí, investigamos el proteoma de (Linaje 6) en las etapas de esporofito y gametofito, utilizando métodos de extracción solubles e insolubles. Identificamos 741 proteínas únicas no redundantes utilizando una base de datos derivada del genoma y 2007 utilizando una base de datos derivada del transcriptoma, que incluía numerosas proteínas que se predijo que eran de origen fúngico. Investigamos además las proteínas derivadas del genoma para centrarnos en proteínas específicas de algas. El análisis de ontología indicó una proporción relativamente grande de proteínas de unión a iones (es decir, hierro, zinc, manganeso, potasio y cobre), que pueden desempeñar un papel en la tolerancia de las algas a metales pesados. Además, identificamos 58 proteínas relacionadas con el estrés (por ejemplo, chaperonas de choque térmico y haloperoxidazas dependientes de vanadio) y 44 proteínas relacionadas con la fotosíntesis (por ejemplo, ficobilisomas, fotosistema I, fotosistema II y ATPasa), que en general se identificaron en mayor abundancia en gametofitos femeninos. Se predijo que 40 proteínas serían secretadas, incluidas diez proteínas similares a colágeno-alfa de rodofitas (RCAPs), que mostraron niveles generales altos de expresión génica. Estos hallazgos proporcionan una visión general completa de las proteínas expresadas en , destacando el potencial para la extracción de proteínas específicas y la caracterización funcional para futuras biodiscoveries.