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Un análisis de bioinformática de datos de cáncer de ovario utilizando aprendizaje automático

Autores: Schilling, Vincent; Beyerlein, Peter; Chien, Jeremy

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Un análisis de bioinformática de datos de cáncer de ovario utilizando aprendizaje automático


Categoría

Ingeniería y Tecnología

Subcategoría

Ingeniería de Software

Palabras clave

Biomarcadores
Diagnóstico de cáncer
Aprendizaje automático
Datos de expresión génica
Resistencia al platino
Genes

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 27

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La identificación de biomarcadores es crucial para el diagnóstico del cáncer, comprender los mecanismos biológicos subyacentes y desarrollar terapias dirigidas. En este estudio, proponemos un enfoque de aprendizaje automático para predecir los resultados de los pacientes con cáncer de ovario y el estado de resistencia a platino utilizando datos de expresión génica públicamente disponibles. Se comparan seis algoritmos clásicos de aprendizaje automático en cuanto a su rendimiento predictivo. Aquellos con la puntuación más alta son analizados por su importancia de características utilizando el algoritmo SHAP. Pudimos seleccionar varios genes que se correlacionaron con el resultado y el estado de resistencia a platino de los pacientes y validamos estos utilizando gráficos de Kaplan-Meier. En comparación con enfoques similares, el rendimiento de los modelos fue superior, y se identificaron diferentes genes mediante el análisis de importancia de características. Los genes identificados más prometedores que podrían usarse como biomarcadores son TMEFF2, ACSM3, SLC4A1 y ALDH4A1.

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