El objetivo de este estudio fue construir un índice de selección mejorado utilizando los parámetros genómicos y económicos de nuevos trastornos de salud y rasgos de producción y funcionales actuales. Se realizó una evaluación genómica para la incidencia de mastitis clínica (MC), tres rasgos de enfermedades de las pezuñas, placenta retenida (PR), metritis (MET) y ovarios quísticos (OQ) utilizando modelos lineales de animales basados en datos registrados por los productores. Se encontraron buenas correlaciones entre los trastornos de salud, y sus estimaciones de heredabilidad no superaron el 7%. Los pesos económicos (PE) para los trastornos de salud fueron EUR -132.10 para MC, EUR -128.87 para enfermedades de las pezuñas en general, EUR -52.10 para PR, EUR -80.48 para MET y EUR -16.16 para OQ. Estos PE indican cambios en el valor presente del beneficio anual por vaca al aumentar la incidencia de los rasgos en un caso por vaca al año. La selección utilizando el índice mejorado resultó en respuestas favorables para la mayoría de los nuevos trastornos de salud (por ejemplo, -0.001 y -0.006 casos de PR y MET por vaca al año, respectivamente), y también en los rasgos del objetivo de cría actual (+49 kg de leche, -0.02% de pérdidas de terneros). Se evaluó una contribución del índice del 7% para los nuevos trastornos de salud como aceptable para los criadores.