El triclosán (TCS), un químico antibacteriano de amplio espectro, se detecta en la orina humana, la leche materna, el líquido amniótico y las heces; sin embargo, se sabe poco sobre su impacto en el microbioma intestinal y la inmunidad mucosa del huésped durante el embarazo y el desarrollo temprano. Ratas hembras embarazadas fueron alimentadas por vía oral con TCS desde el día 6 de gestación (GD) hasta el día 28 posparto (PP). La descendencia recibió TCS desde el día 12 posnatal (PND) hasta el 28. Se realizaron estudios para evaluar los cambios en la población microbiana intestinal (secuenciación de 16S-rRNA) y el análisis funcional de los genes microbianos en animales expuestos a TCS durante el embarazo (GD18), y en PP7, PP28 y PND28. La abundancia microbiana se comparó con las cantidades de TCS excretadas en las heces y los niveles de IgA en las heces. Los resultados revelan que el TCS disminuye la abundancia de y con un aumento significativo en . En PND28, las Unidades Taxonómicas Operacionales (OTUs) totales fueron más altas en hembras y mostraron correlación con los niveles de TCS y IgA no unida en las heces. El aumento significativo en en todas las ratas tratadas con TCS junto con el aumento de la abundancia en OTUs que pertenecen a comunidades bacterianas patógenas podría servir como una firma de disbiosis inducida por TCS. En conclusión, el TCS puede perturbar el microbioma, las actividades funcionales del microbioma y activar la inmunidad mucosa durante el embarazo y el desarrollo temprano.