Las prácticas inteligentes para el clima son acciones que se pueden implementar sin afectar las actividades agrícolas y que pueden promover estas actividades, generando beneficios directos e indirectos en la provisión de servicios ecosistémicos y aumentando la productividad agrícola y los ingresos privados. El presente estudio evaluó el efecto de tres acciones inteligentes para el clima (establecimiento de árboles aislados, recuperación de vegetación ribereña e implementación de cercas vivas) en el aumento de la conectividad funcional del paisaje y el almacenamiento de carbono. Se probaron tres escenarios con tasas de participación que oscilaban entre el 5 y el 100% en dos cuencas con diferentes grados de conservación y una alta prioridad para la producción de alimentos nacional en México. Los principales resultados sugieren que las prácticas inteligentes para el clima impactan positivamente en la conectividad del paisaje y la captura de carbono. Sin embargo, la mejora en la conectividad del paisaje beneficia principalmente a especies de desplazamiento corto (50-100 m), y el aumento en el almacenamiento de carbono es directamente lineal al área implementada en estas prácticas. Además, la efectividad de las acciones modeladas depende de la estructura del paisaje, que se implementó con los mayores beneficios en cuencas con intensa actividad agrícola. Los hallazgos pueden apoyar a los tomadores de decisiones en la selección de las mejores estrategias para aumentar la conectividad del paisaje y la captura de carbono en paisajes productivos.