Este estudio proporciona la base para implementar un sistema de tratamiento continuo para aguas residuales que contienen una mezcla de pesticidas formada por atrazina, iprodiona y clorpirifos. Dos cepas fúngicas (sp. H5 y sp. H12) aisladas de una biomixtura de un sistema de biopurificación pudieron eliminar eficientemente diferentes concentraciones de pesticidas (10 a 50 mg L) del medio líquido; sin embargo, la vida media de los pesticidas se redujo y se caracterizó por un T de 5.4 a 9.2 días para la atrazina, de 3.7 a 5.8 días para la iprodiona y de 2.6 a 2.9 días para el clorpirifos utilizando el consorcio fúngico. La inmovilización del consorcio fúngico en perlas de alginato fue efectiva, con la mayor eliminación de pesticidas observada utilizando una concentración de inóculo del 30% p/v. El reactor de lecho empacado con el consorcio fúngico inmovilizado, que operaba en modo continuo a diferentes caudales (30, 60 y 90 mL h), requirió aproximadamente 10 días para lograr una eficiencia de eliminación (atrazina: 59%; iprodiona: 96%; clorpirifos: ~85%). El biorreactor fue sensible a las fluctuaciones del caudal pero pudo recuperar rápidamente su rendimiento. Se produjeron metabolitos de pesticidas como hidroxiatrazina, 3,5-dicloroanilina y 3,5,6-tricloro-2-piridinol, y se observó una ligera acumulación de 3,5,6-tricloro-2-piridinol. Sin embargo, la eficiencia de eliminación del reactor se mantuvo hasta que finalizó el estudio (60 días).