El objetivo del estudio fue evaluar el efecto del tratamiento de microondas en la germinación de semillas y la salud de las semillas de zanahoria utilizando dos lotes de semillas infectadas naturalmente con los patógenos y. Las semillas de cv. Amsterdam y cv. Berlikumer variaron en la germinación de semillas en el recuento final (50% y 29%, respectivamente), y la infestación de semillas con (38% y 5%, respectivamente). Para el tratamiento, las semillas se colocaron en una placa de Petri (tratamiento en seco) o en un vaso con agua destilada (tratamiento húmedo) e irradiadas a niveles de potencia de salida de 500, 650 y 750 W durante 15, 30, 45, 60, 75 y 90 s. La germinación y la salud se determinaron en muestras de semillas tratadas y no tratadas (control). El tratamiento húmedo controló de manera más eficiente los hongos transmitidos por semilla que el tratamiento en seco. Sin embargo, la duración de exposición más larga de 60 s resultó frecuentemente en el deterioro de la germinación de las semillas. La mayor germinación de semillas en cv. Amsterdam se observó después del tratamiento húmedo de microondas a niveles de potencia de salida de 500 W durante 75 s (81%), 650 W durante 45 s (85%) y 750 W durante 60 s (77%), mientras que en el caso de cv. Berlikumer esto ocurrió cuando las semillas húmedas se trataron a 500 y 650 W durante 60 s (46% y 43% respectivamente). El tratamiento de semillas remojadas en agua con microondas por un período más largo de 30 s, independientemente de la potencia de salida, disminuyó significativamente la infestación de semillas con spp. en ambas muestras.