La prevención y control de los saltahojas representan problemas importantes para la producción de arroz. Los métodos actuales de control a largo plazo dependen de pesticidas, lo que plantea preocupaciones sobre la contaminación ambiental. Recientemente, la evidencia ha sugerido que los simbiontes bacterianos son factores importantes que influyen en la formación de biotipos de insectos Hemiptera y la selección de plantas hospederas para los insectos, lo que sugiere que dirigirse a las comunidades bacterianas puede ser un método alternativo efectivo para el control de los saltahojas. En este estudio, perturbamos las comunidades bacterianas del saltahojas pardo, alimentándolos con arroz tratado con antibióticos y utilizamos RNA-seq para examinar el transcriptoma del arroz normal alimentado con saltahojas perturbados por RNA-seq. Nuestros resultados mostraron que la composición de las comunidades bacterianas cambió significativamente después de la perturbación, lo que estuvo acompañado de cambios en procesos biológicos distintos del arroz, especialmente la vía de biosíntesis de fenilpropanoides, en comparación con el efecto de la alimentación de saltahojas en arroz sin perturbación de las comunidades bacterianas. Nuestro trabajo establece un protocolo para la perturbación de las comunidades bacterianas en saltahojas, demostrando el vínculo entre la comunidad bacteriana y las respuestas a la alimentación de saltahojas y proporcionando nuevos conocimientos sobre la interacción entre los saltahojas y el arroz.