El análisis a nivel del transcriptoma reveló el potencial del transportador de potasio de alta afinidad (familia de genes) en la tolerancia a la salinidad del arroz a través de la homeostasis iónica
Autores: Hussain, Shahid; Zhang, Rui; Liu, Shuli; Li, Rongkai; Zhou, Yicheng; Chen, Yinglong; Hou, Hongyan; Dai, Qigen
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
El análisis a nivel del transcriptoma reveló el potencial del transportador de potasio de alta afinidad (familia de genes) en la tolerancia a la salinidad del arroz a través de la homeostasis iónica
Categoría
Ingeniería y Tecnología
Subcategoría
Bioingeniería
Palabras clave
Transportador de potasio
Genes
Estrés salino
Sodio
Potasio
Arroz
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 33
Citaciones: Sin citaciones
Los genes transportadores de potasio de alta afinidad son transportadores clave de iones, que regulan la respuesta de la planta al estrés salino a través de la homeostasis del sodio (Na) y el potasio (K). El objetivo principal de esta investigación fue encontrar y comprender los genes en arroz y sus posibles actividades biológicas en respuesta a brassinosteroides (BRs), ácido jasmónico (JA), agua de mar y estrés por NaCl. Los análisis in silico de siete genes involucraron su árbol evolutivo, estructuras génicas, motivos conservados y propiedades químicas, resaltando los aspectos clave de los genes. El análisis de la Ontología Génica (GO) de los genes reveló sus roles en el crecimiento y respuestas al estrés. El análisis del promotor mostró que la mayoría de los genes participan en respuestas al estrés abiótico. El análisis de expresión específico de tejido mostró una actividad transcripcional más alta de los genes en raíces y hojas. Bajo la aplicación de NaCl, BR y JA, se expresó de manera diferencial en raíces y brotes. De manera similar, el patrón de expresión inducido de se registró en el cultivar resistente al agua de mar (SWR). Además, se evaluó la relación Na/K bajo diferentes concentraciones de estrés por NaCl. Nuestros datos resaltaron el importante papel de la familia de genes en la regulación de la tolerancia a la salinidad del arroz mediada por JA y BR, y podrían ser útiles para los futuros programas de mejoramiento del arroz.
Descripción
Los genes transportadores de potasio de alta afinidad son transportadores clave de iones, que regulan la respuesta de la planta al estrés salino a través de la homeostasis del sodio (Na) y el potasio (K). El objetivo principal de esta investigación fue encontrar y comprender los genes en arroz y sus posibles actividades biológicas en respuesta a brassinosteroides (BRs), ácido jasmónico (JA), agua de mar y estrés por NaCl. Los análisis in silico de siete genes involucraron su árbol evolutivo, estructuras génicas, motivos conservados y propiedades químicas, resaltando los aspectos clave de los genes. El análisis de la Ontología Génica (GO) de los genes reveló sus roles en el crecimiento y respuestas al estrés. El análisis del promotor mostró que la mayoría de los genes participan en respuestas al estrés abiótico. El análisis de expresión específico de tejido mostró una actividad transcripcional más alta de los genes en raíces y hojas. Bajo la aplicación de NaCl, BR y JA, se expresó de manera diferencial en raíces y brotes. De manera similar, el patrón de expresión inducido de se registró en el cultivar resistente al agua de mar (SWR). Además, se evaluó la relación Na/K bajo diferentes concentraciones de estrés por NaCl. Nuestros datos resaltaron el importante papel de la familia de genes en la regulación de la tolerancia a la salinidad del arroz mediada por JA y BR, y podrían ser útiles para los futuros programas de mejoramiento del arroz.