El análisis transcriptómico revela el mecanismo regulador de la diversidad de color en el dulce (Ericaceae)
Autores: Zhu, Nanyan; Zhou, Chunhua
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
El análisis transcriptómico revela el mecanismo regulador de la diversidad de color en el dulce (Ericaceae)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Tradicional
Planta
Formación del color de la flor
Análisis del transcriptoma
Genes
Muestras de pétalos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
Sweet es una planta ornamental tradicional cultivada en China y presenta una gran variación en la coloración de los pétalos. Sin embargo, se han realizado pocos estudios para revelar los genes involucrados y el mecanismo regulador de la formación del color de las flores en esta planta. En este estudio, para explorar la base genética subyacente de la formación del color de las flores, se realizó un análisis de transcriptoma mediante técnicas de secuenciación de alto rendimiento en cuatro muestras de pétalos de diferentes colores: púrpura, rosa, rosa claro y blanco. Los resultados muestran que se obtuvieron un total de 35.55 a 40.56 millones de lecturas limpias de alta calidad, de las cuales 28.56 a 32.65 millones de lecturas se mapearon al genoma de referencia. Para su anotación, se asignaron 28,273, 18,054, 24,301, 19,099 y 11,507 genes a las bases de datos Nr, Swiss-Prot, Pfam, GO y KEGG, respectivamente. Hubo genes expresados diferencialmente entre las cuatro muestras de pétalos diferentes, incluidos genes relacionados con la transducción de señales, genes de biosíntesis de antocianinas y factores de transcripción. Encontramos que los niveles de expresión más altos de genes asociados con la flavonol sintasa (FLS) podrían ser la clave para la formación del blanco, y la formación del color rojo puede estar relacionada con la mayor expresión de las familias de flavanona 4-reductasa (DFR). En general, nuestro estudio proporciona información valiosa para explorar y comprender la variación en la intensidad del color de las flores.
Descripción
Sweet es una planta ornamental tradicional cultivada en China y presenta una gran variación en la coloración de los pétalos. Sin embargo, se han realizado pocos estudios para revelar los genes involucrados y el mecanismo regulador de la formación del color de las flores en esta planta. En este estudio, para explorar la base genética subyacente de la formación del color de las flores, se realizó un análisis de transcriptoma mediante técnicas de secuenciación de alto rendimiento en cuatro muestras de pétalos de diferentes colores: púrpura, rosa, rosa claro y blanco. Los resultados muestran que se obtuvieron un total de 35.55 a 40.56 millones de lecturas limpias de alta calidad, de las cuales 28.56 a 32.65 millones de lecturas se mapearon al genoma de referencia. Para su anotación, se asignaron 28,273, 18,054, 24,301, 19,099 y 11,507 genes a las bases de datos Nr, Swiss-Prot, Pfam, GO y KEGG, respectivamente. Hubo genes expresados diferencialmente entre las cuatro muestras de pétalos diferentes, incluidos genes relacionados con la transducción de señales, genes de biosíntesis de antocianinas y factores de transcripción. Encontramos que los niveles de expresión más altos de genes asociados con la flavonol sintasa (FLS) podrían ser la clave para la formación del blanco, y la formación del color rojo puede estar relacionada con la mayor expresión de las familias de flavanona 4-reductasa (DFR). En general, nuestro estudio proporciona información valiosa para explorar y comprender la variación en la intensidad del color de las flores.