Análisis de todo el transcriptoma del hipocampo de ratas expuestas repetidamente a bajos niveles de sarín e identificación de redes Cerna para investigar el mecanismo de deterioro cognitivo inducido por el sarín
Autores: Shi, Jingjing; Liu, Dongxin; Jin, Qian; Chen, Xuejun; Zhang, Ruihua; Shi, Tong; Zhu, Siqing; Zhang, Yi; Zong, Xingxing; Wang, Chen; Li, Liqin
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Análisis de todo el transcriptoma del hipocampo de ratas expuestas repetidamente a bajos niveles de sarín e identificación de redes Cerna para investigar el mecanismo de deterioro cognitivo inducido por el sarín
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Sarin
Deterioro cognitivo
Densidad de espinas dendríticas
Análisis del transcriptoma
Plasticidad sináptica
Red de ceRNA
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 16
Citaciones: Sin citaciones
Sarin es un potente agente nervioso organofosforado que causa disfunción cognitiva, pero sus mecanismos moleculares subyacentes son poco comprendidos. En este estudio, se estableció un modelo de rata de exposición repetida a bajo nivel de sarin mediante la inyección subcutánea de 0.4 x LD durante 21 días consecutivos. Las ratas expuestas a sarin mostraron un deterioro persistente del aprendizaje y la memoria, así como una reducción en la densidad de espinas dendríticas en el hipocampo. Se aplicó un análisis de todo el transcriptoma para estudiar el mecanismo del deterioro cognitivo inducido por sarin, y se encontraron un total de 1035 mRNA diferencialmente expresados (DEmRNA), incluidos 44 DEmiRNA, 305 DElncRNA y 412 DEcircRNA, en el hipocampo de ratas tratadas con sarin. Según la anotación de Gene Ontology (GO), el enriquecimiento de la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kyoto (KEGG) y el análisis de Interacción Proteína-Proteína (PPI), estos DERNAs estaban principalmente involucrados en la plasticidad sináptica neuronal y estaban relacionados con la patogénesis de enfermedades neurodegenerativas. Se construyó la red ceRNA circRNA/lncRNA-miRNA-mRNA, en la que Circ_Fmn1, miR-741-3p, miR-764-3p, miR-871-3p, KIF1A, PTPN11, SYN1 y MT-CO3 formaron un circuito, y Circ_Cacna1c, miR-10b-5p, miR-18a-5p, CACNA1C, PRKCD y RASGRP1 constituyeron otro circuito. El equilibrio entre los dos circuitos fue crucial para mantener la plasticidad sináptica y puede ser el mecanismo regulador por el cual el sarin causa deterioro cognitivo. Nuestro estudio revela por primera vez el mecanismo de regulación ceRNA de la exposición al sarin y proporciona nuevas perspectivas sobre los mecanismos moleculares de otros tóxicos organofosforados.
Descripción
Sarin es un potente agente nervioso organofosforado que causa disfunción cognitiva, pero sus mecanismos moleculares subyacentes son poco comprendidos. En este estudio, se estableció un modelo de rata de exposición repetida a bajo nivel de sarin mediante la inyección subcutánea de 0.4 x LD durante 21 días consecutivos. Las ratas expuestas a sarin mostraron un deterioro persistente del aprendizaje y la memoria, así como una reducción en la densidad de espinas dendríticas en el hipocampo. Se aplicó un análisis de todo el transcriptoma para estudiar el mecanismo del deterioro cognitivo inducido por sarin, y se encontraron un total de 1035 mRNA diferencialmente expresados (DEmRNA), incluidos 44 DEmiRNA, 305 DElncRNA y 412 DEcircRNA, en el hipocampo de ratas tratadas con sarin. Según la anotación de Gene Ontology (GO), el enriquecimiento de la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kyoto (KEGG) y el análisis de Interacción Proteína-Proteína (PPI), estos DERNAs estaban principalmente involucrados en la plasticidad sináptica neuronal y estaban relacionados con la patogénesis de enfermedades neurodegenerativas. Se construyó la red ceRNA circRNA/lncRNA-miRNA-mRNA, en la que Circ_Fmn1, miR-741-3p, miR-764-3p, miR-871-3p, KIF1A, PTPN11, SYN1 y MT-CO3 formaron un circuito, y Circ_Cacna1c, miR-10b-5p, miR-18a-5p, CACNA1C, PRKCD y RASGRP1 constituyeron otro circuito. El equilibrio entre los dos circuitos fue crucial para mantener la plasticidad sináptica y puede ser el mecanismo regulador por el cual el sarin causa deterioro cognitivo. Nuestro estudio revela por primera vez el mecanismo de regulación ceRNA de la exposición al sarin y proporciona nuevas perspectivas sobre los mecanismos moleculares de otros tóxicos organofosforados.