El ritmo hepático tiene un efecto significativo en el metabolismo de lípidos y la función inmune en las gallinas. Sin embargo, los informes sobre sus mecanismos subyacentes y genes clave son relativamente escasos. Recogimos muestras de hígado en siete puntos temporales durante un ciclo de luz/oscuridad e investigamos los genes y vías candidatas relacionadas con el ritmo hepático a través de la secuenciación transcriptómica. El análisis de tendencias reveló que la expresión de genes en el Perfil 5 exhibió fluctuaciones rítmicas, y estos genes estaban enriquecidos en función inmune y ritmo biológico. Los genes en el Perfil 2 que estaban relacionados con el metabolismo de lípidos también exhibieron una tendencia rítmica. Se detectaron un total de 845 genes expresados diferencialmente entre las condiciones de luz/oscuridad. El metabolismo de lípidos y las funciones inmunes mostraron los mayores cambios entre las dos condiciones. Los procesos relacionados con la inmunidad fueron más activos en la fase de luz, mientras que en la fase oscura, el metabolismo de lípidos fue más activo. El análisis de red de coexpresión génica ponderada reveló que los módulos marrón y cian estaban fuertemente asociados con el ritmo circadiano hepático. El análisis cosinor reveló que 9 genes relacionados con lípidos y 11 genes relacionados con la inmunidad exhibieron una expresión rítmica significativa. Estos hallazgos revelaron cambios rítmicos en el metabolismo inmune y de lípidos hepáticos, proporcionando importantes conocimientos sobre la regulación de la resistencia a enfermedades y la deposición de lípidos en las gallinas.